Läs mer om Paenibacillus-stammen VT 400
Sommaren 2016 samlades forskare vid det årliga mötet i American Society for Microbiology för att dela och diskutera fynd relaterade till bakterier och människors hälsa.
Bland funderingarna rapporterade en grupp om hela genomet, eller den kompletta uppsättningen gener, för en bakterie som heter Paenibacillus species stam VT 400 (PVT400). Dessa bakterier hade tidigare funnits i saliv hos en pediatrisk patient med akut lymfoblastisk leukemi (ALL).
Den detaljerade informationen från detta och framtida studier kommer att hjälpa forskare att veta om dessa bakterier kan ha en roll i människors sjukdom, särskilt hos personer med akut leukemi som utvecklar lunginflammation eller blodinfektioner.
Lunginflammation hos personer med cancer
Lunginflammation är den främsta orsaken till död hos cancerpatienter med neutropeni, och särskilt de med akut leukemi. Neutropeni är ett lågt antal neutrofiler i blodnutrofilerna är vita blodkroppar som är viktiga för att hjälpa kroppen att bekämpa infektion .
Lägre luftvägsinfektioner är mycket vanliga hos cancerpatienter, med några rapporter som visar att 13 till 31 procent av leukemipatienter som får kemoterapi och upp till 80 procent av hematopoetiska stamcellstransplantatmottagare kommer att uppleva minst en episode av lunginflammation.
Neutropenisk lunginflammation är potentiellt livshotande infektioner. I sådana situationer startar läkare omedelbart antibiotikabehandling utan att vänta på att laboratorieresultatet bekräftar och specificerar typen av bakterieinfektion, eftersom det är så viktigt att man påbörja behandlingen samtidigt för att minska risken för att patienten kommer att bota smittan.
Faktum är att förebyggande terapi används under vissa omständigheter, vilka beskrivs nedan.
Nya framsteg i hanteringen av neutropenisk lunginflammation är ett stort hopp om bättre resultat. Flera medicinska samhällen har utfärdat uppdaterade riktlinjer för antibiotikabehandling av misstänkt neutropenisk lunginflammation.
Och det är möjligt att nyare agenter som främjar kroppens svar på infektioner kan ytterligare förbättra antibiotikans aktivitet.
Fokusera på patogener hos patienter med neutropeni
Riktlinjer från American Society of Clinical Oncology (ASCO) rekommenderar att läkare försöker förhindra infektion hos polikliniker med djup neutropeni men ingen feber. Antibakteriell och antifungal behandling rekommenderas om neutrofiler förväntas ligga under 100 / μl i mer än sju dagar. Riktlinjen anger att det föredragna medlet för antibakteriell förebyggande terapi är en oral fluorokinolon, medan den för antifungal behandling är en oral triazol.
Patienter med neutropeni är mottagliga för ett mycket större antal patogener än deras motsvarigheter. Det kan vara till hjälp för läkare att överväga var bakterierna kom ifrån för att förutsäga vilka antibiotika de sannolikt kommer att vara resistenta mot, och vilka strategier som troligtvis är mest effektiva.
Paenibacillus Species
Mot det ändamålet har forskare studerat PVT400, de nya bakterierna isolerade från leukemipatienten, en medlem av genus Paenibacillus-en familj av stavformade bakteriearter. Olika arter inom denna grupp har isolerats från mark, vatten, växter, mjölk och andra platser.
Men Paenibacillus-arter var inte kända för att orsaka mänsklig sjukdom. .. tills de senaste rapporterna visade att det var möjligt att involvera tre olika Paenibacillus-arter i humana sjukdomar.
Efter att PVT 400 isolerats från saliv hos en pediatrisk patient med akut lymfoblastisk leukemi visade tidiga studier någon likhet av dessa isolat med amylolyticus-arterna, som finns i larvens hindgut av flugan; Hittills är det dock fortfarande sant att P. amylolyticus inte har detekterats hos människor, och ytterligare studier visade skillnader mellan stam-VT 400-bakterier som finns i cancerpatienten och andra P.
amylolyticus stammar.
Så, när utredare studerade hela VT 400-genomet, fanns det ett antal intressanta resultat. Det hade gener som kodar motståndsmekanismer till kemoterapidroger , som tunicamycin och bleomycin. De fann också gener för bakteriella pumpar associerade med multidrugsresistens, liksom gener som kodar motståndskraft mot antibiotika, inklusive vankomycin, fosmidomycin, tetracyklin samt penicillinlika läkemedel eller beta-laktamerna.
Författarna till denna genomstudie noterade att den fullständiga genomsekvensen av Paenibacillus sp. stam VT 400 kommer att bidra till att bestämma rollen av Paenibacillus-arter i mänskliga sjukdomar och ge insikter i sammansättningen av de normala bakterierna som lever hos patienter med blodcancer.
källor:
> Evans SE, Ost DE. Lunginflammation hos patienter med neutropenisk cancer. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Komplett genomsekvens av Paenibacillus polymyxa stam SB3-1, en jordburen bakterie med antagonistisk aktivitet mot växtpatogener. Genommeddelande . 2015; 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. Genoom av Pseudomonas sp. FeS53a, en förmodad växttillväxtfrämjande bakterie associerad med ris odlat i järnbelastade jordar. Genommeddelande. 2015; (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et al. Övervakning av New Zealand apiaries för Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H, et al. Paenibacillus sputi sp. nov., isolerad från sputum hos en patient med lungsjukdom. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Ny ASCO riktlinje om neutropeni och feber. Medscape Medical News. 16 jan 2013. Finns på http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Blommor CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et al. Antimikrobiell profylax och öppenvårdshantering av feber och neutropeni hos vuxna behandlade för malignitet: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.